Comparative Biochemistry and Physiology Part B: biochemistry and molecular biology publica artigos em fisiologia comparativa, ambiental e evolutiva. Parte B: biologia, bioquímica e molecular enfoca fisiologia bioquímica, principalmente bioenergética/metabolismo energético, biologia celular, respostas de estresse celular, enzimologia, metabolismo intermediário, estrutura macromolecular e função, regulação genética, genética evolutiva. A maioria dos estudos se concentram em análises bioquímicas ou moleculares que têm ramificações claras para os processos fisiológicos.